1、 棉苗病害。棉苗病害中危害最大的有三种，立枯病、炭疽病和危害棉叶的黑斑病。 炭疽病是我国棉区普遍发生的一种苗期病害，长江流域棉区的发生尤为严重，一般苗期发病率20％～70％，严重时可达90％。立枯病经常发生、分布广泛。我国各大棉区每年均有不同程度的发生。立枯病严重时病苗率可达90％以上，死苗率30～40％。黑斑病又叫轮纹叶斑病，是棉花苗期叶部病害中分布最广、流行面积最大、流行频率最高的病害，阴湿多雨年份往往猖獗流行，给棉花生产造成毁灭性灾害。
2、棉铃病害。棉花铃病主要表现为烂铃。棉花烂铃是棉田极为普遍的病害，是由多种病菌造成的结果。棉铃感病后，轻的形成僵瓣，重的全铃烂毁。在腐烂的棉铃中65％全无收成，20％形成僵瓣，15％的后期轻烂铃可以收到一些籽棉。而且烂铃多是中下部的棉铃，因此对产量的影响很大。通常我国北部棉区比南部棉区烂铃轻，一般棉田烂铃率为5～10％，多雨年份可达到30～40％。长江流域棉区常年烂铃率10～30％，严重的达50～90％以上。尤其飓风来临时，损失更为惨重。按铃病较轻的河北的烂铃损失来算，1983～1988年间平均全国棉田按8000万亩计算，因烂铃造成的损失为15亿元。
3、棉枯、黄萎病。全国每年因棉花枯、黄萎病损失皮棉产量7.5～10万吨。棉花枯、黄萎病在我国大部分棉花病田混生为害，据1983年全国普查，两病发生遍及21个植棉省、自治区、直辖市的574个县。1983年普查时的为害面积为2223万亩，其中 绝产面积为31万亩。棉花枯、黄萎病混生的地区，往往在同一块地里两种病害均有发生，甚至在同一棉株上同时受两病侵染为害，损失明显加重，一般减产20～30％，严重的减产60％以上，甚至无收成，混生病株比无朱的单株产量下降37％，单株结铃数下降27％。据估算，枯、黄萎病为害重的年份，全国每年损失皮棉约150～200万担，其中主要是枯萎病的危害。
4、棉铃虫。全国各棉区均有发生。黄河流域常年发生量大为害重，是常发区。 1990年以后，棉铃虫连续大发生，特别是1992年第二代棉铃虫的发生量为历年所罕见，据河南新乡，河北邯郸调查，在卵高峰期当日百株卵量超过1000粒，累计卵量超过10000粒，百株幼虫量一般棉田均达100多头，为害重的地块，棉株嫩顶和幼蕾被害率达90％，个别地块甚至将棉叶吃光，形成光杆。长江流域棉区为间歇性大发生。自1970年起在发生的频率明显增多。如1971、1972、1978、1982、1990年，3、4代棉铃虫在湖北、江苏、江西、浙江、安徽等省棉区曾大发生，若防治不及时，常造成棉花产量损失
5、棉蚜。我国已发现的为害棉花的蚜虫共有五种：苜蓿蚜、棉长管蚜、菜豆根蚜、拐枣蚜、棉蚜。除新疆外各棉区均以棉蚜为主要为害种。新疆的主要是棉长管蚜、苜蓿蚜、拐枣蚜、菜豆根蚜。 棉蚜的发生以辽河流域、黄河流域、和西北的陕西、甘肃棉区为害重，长江流域为害次之，华南棉区干旱年份发生较重，一般年份发生轻。
6、棉红蜘蛛。棉红蜘蛛又叫棉叶螨在我国主要有三种：朱砂叶螨、截形叶螨、土尔其斯坦叶螨。土尔其斯坦叶螨只分布在新疆。其他两种在南北方都有分布。一般所说的棉红蜘蛛是指前两种叶螨的混合群体。棉红蜘蛛的为害是在棉叶背面吸食汁液。在干旱年份棉红蜘蛛为害猖獗，轻者棉苗停止生长，蕾铃脱落，后期早蓑；重者叶片发红，干枯脱落，棉花变成光杆。
7、棉红铃虫。棉红铃虫是一种世界性害虫，广泛分布于北纬40度以南的各产棉国家。我国除新疆、甘肃河西走廊和部分西北内陆棉区外，广泛分布于南起海南北至辽宁的产棉省区。红铃虫的为害引起的损失因地区不同而不同，中国在50年代考查时，在长江流域棉区常年因红铃虫为害的综合损失率为28%，黄河流域棉区为12%。据测定：每铃有虫一头，籽棉重量损失6～10%，僵瓣增加5～6%，品质降低1～2级，总计损失15～20%。虫量增加损失加重。
8、棉盲蝽。危害棉花的盲蝽在我国主要有6种：绿盲蝽、中黑盲蝽、三点盲蝽、苜蓿盲蝽、赣棉盲蝽、牧草盲蝽。盲蝽为害都是用刺吸口器刺进植物的嫩头、生长点或幼嫩果实，吸取汁液。造成幼嫩果实体直接脱落；生长点破坏，组织受损形成空洞；阻碍生长点正常发育使植物营养失调，生育受到影响。50年代国中期，陕西关中地区的棉花受盲蝽为害达29.5%花蕾脱落21.2～38.6％产量减少20～30％长江流域棉区的江西，安徽和湖北棉株受害达20～40％, 江西彭泽达90％，产量损失约50％。70年代以来，由于间套作复杂，绿肥蚕豆面积扩大，作物种类增多，冬耕田面积减少，棉花育苗移栽，地膜覆盖，棉苗发育早，生长旺盛，局部地区如江苏、上海、浙江、安徽的沿海棉区，盲蝽成为主要害虫。

         据我国权威气象部门发布的消息，去年冬季，是1998-1999年以来我国第二个温度较高的冬季，也是多年暖冬中较暖的季节。同时，又根据我们大面积多点调查显示，今年的油菜开花和小麦拔节要比常年提早10~15天。正是由于气温回暖快，好些棉区的农民询问，今年的棉花是否可以提早播种？而且有的农民已经整好了棉花育苗的苗床，也整好了大田棉花的预留棉行，有的打算现在就播种育苗。　　
　　 到底能不能将棉花的播种期提早呢？根据多年棉花播种的实践，这方面的教训是十分深刻的。的确，采用塑料薄膜覆盖实行营养钵育苗，也可以在3月中下旬播种于4月上旬培育出棉苗，生产上也曾大面积作过示范，但其结果是管理难度很大，也难以确保全苗壮苗。一是4月上中旬寒潮频繁，气温变幅很大，北风光顾的次数多，苗床薄膜的揭盖很不好把握；二是若遇上连续阴雨天气，苗床上的棉苗难以通风透气，极易形成线苗，导致棉苗倒伏；三是低温阴雨也易诱发立枯、炭疽、猝倒等病害，致使苗床成片死苗；四是早播种，使棉苗苗龄延长，迫使棉苗过早地移栽到大田，早栽的棉苗碰上寒潮，常因死苗造成缺苗断垄，一般缺苗10%~20%，严重的缺苗30%~50%。近几年，棉花生产上推出的新品种很多，特别是杂交抗虫棉，价格较贵。若是缺苗面积过大，既要造成经济损失，也使棉花难以做到一次播种、一次移栽、一次全苗，计划中的棉田面积常会落空，更难以确保种优良棉种夺取高产丰收。　　　面对暖冬气候的出现，在优良棉种的播种期上，应当作出怎样的抉择呢？据多年的经验，为了使优良棉种不受或少受损失，在营养育苗移栽技术上，应该着重把握以下环节。　

            了解棉花出苗对温度的要求　据研究，棉种萌芽最低的极限温度为10.5℃，出苗的温度在12℃以上，播种出苗的活动积温为80℃~100℃，满足了温度的要求就可正常出苗。　　　了解当地的气候规律　以长江中游为例，3月下旬的平均气温在9℃以上，4月上旬平均气温在13℃以上，4月中旬的平均气温在16℃以上，因此，4月上旬可以试播，中旬可集中时间、集中劳力突击大播，这个时期播种是比较可靠的。
　　 做到壮苗安全适期移栽　一般而言，4月下旬末至5月上旬移栽棉花钵苗，或者是棉苗有3片真叶移栽比较安全，因为这时幼茎开始木质化，抗逆能力增强。从固有的经验来说，叫做“时到不等苗，苗到不等时”。